Entre nossas coleções estão: uma Carpoteca, uma Sementeca, uma Xiloteca, uma coleção de Microalgas e Cianobactérias, um Jardim Sensorial, uma Coleção Viva e uma Galhateca.
Carpoteca do Herbário UFMT - Armazenamos amostras de frutos e sementes se amostras de plantas. Essa coleção é dividida em duas áreas, a coleção científica - que reúne as amostras vinculadas às exsicatas da coleção geral, e a coleção didática - que reúne amostras que são coletadas aleatoriamente e são utilizadas em exposições e atividades de ensino.
Sementeca do Herbário em associação com o Laboratório de Sementes Nativas da UFMT (LASEMNA) - Armazenamos sementes representativas da flora da Amazônia, Cerrado e Pantanal. A coleção também está organizada em Científica (vinculada às espécies e espécimes estudados no LASEMNA) e Didática, destinada à ação de ensino e itinerância.
Xiloteca do Herbário UFMT - é uma coleção pequena, criada para abrigar amostras de projetos de pesquisa realizados por pesquisadores do Instituto de Biociências. Também é utilizada em atividades de ensino e exposições.
Coleção de Microalgas e Cianobactérias do Herbário UFMT - esta coleção reúne amostras de água coletadas principalmente do Pantanal de Mato Grosso.
Jardim Sensorial do Herbário UFMT - cultivamos espécimes posicionados para receber visitas de pessoas com limitações. Entre as espécies estão plantas aromáticas, aquáticas e com texturas e consistências diferentes.
